“控制理论与控制工程”学科是经过国务院学位委员会首批（1981年11月）批准设立的硕士学位授权点之一，1998年4月批准设立博士学位授权点。
该博士学位授权点由“控制理论与控制工程”、“模式识别与智能系统”、“系统工程”三个硕士学位授权点支撑。
“控制理论与控制工程”学科具有学科基础扎实、发展潜力大、学科交叉和辐射领域宽的特点。因此，吉林大学将控制学科列入优先重点建设学科，已列入国家“211工程”和“985工程”建设项目。其中，“现代控制工程开放研究实验室”是“211工程”建设实验室，仿生行走与自主作业机械系统控制理论与技术、汽车先进技术底盘控制技术列入“985二期工程”科技创新平台建设。
经过多年的建设与发展，控制理论与工程学科在复杂系统建模、优化与控制，分布式智能系统与网络控制，机器视觉与视觉伺服技术，约束系统优化控制理论、方法及应用，智能机械与机器人控制，现代信号处理理论与方法，企业信息化与生产过程综合自动化等方面形成了本学科的优势与特色。
本学科重视基础理论研究和应用基础研究，重视科研成果的转化与工程应用研究，积极发挥高等学校的科学研究、人才培养和服务社会的职能。
目前已经培养博士研究生20多人。每年招收博士研究生10人左右，招收硕士研究生50余人。
近五年，本系承担国家青年基金重点项目、“十五”科技攻关项目、国家863高技术研究计划项目、国家自然科学基金重点项目、吉林科技发展计划（高技术）重大项目和重点项目以及其他部省级项目共40余项，科研经费总额两千多万元；研究成果获省部级科技进步奖6项；获发明专利6项；在国内外著名学术刊物和重要学术会议发表论文420篇，收入sci、ei、istp检索论文200多篇，出版专著和教材五部。
经过多年的发展，形成得主要研究方向为：复杂系统建模、优化与控制；先进控制理论、方法及应用；智能机械与机器人控制；现代信号处理与智能测控系统等。
开设的主要课程有：非线性分析，小波理论，实变函数与泛函分析，lmi控制，自主系统规划与控制，控制系统稳定性与鲁棒性，现代滤波理论等。
